沉默的内源性的DNA
我们先前发现的一种拟南芥sde4
突变说,展出的部分失去一个transgenesilencing
通路是否则依赖
对RNA依赖的RNA聚合酶六日
( rdr6 ) ( 1 ) 。该sde4突变体植株还
有缺陷的小分子干扰RNA (小分子干扰核糖核酸)
生产和甲基正弦retroelement
atsn1 ( 2 )在通路其后
相关rdr2 , Dicer的样三日
( dcl3 ) ,以及其他内源性的siRNA ( 3 ) 。它
很可能,这沉默通路相关
以RNA干涉( RNAi技术)介导heterochromatinization
在schizosaccharomyces
pombe这也是依赖于小分子干扰核糖核酸, Dicer的,
andanrdr ( 4 ) 。所以,要调查
机制的两个转基因与retroelement
沉默,我们查处的分子
身份的sde4轨迹。我们这里所叙述
如何sde4编码最大亚基一
编码RNA聚合酶是有别于
真核细胞的RNA聚合酶的一,二和三
(其亚基在拟南芥中被指定
由前缀nrpa , nrpb ,或nrpc ,分别) 。
在符合公约
命名的RNA聚合酶的,我们从今以后参考
这种酶作为RNA聚合酶四(油料
四)和世界上最大的亚基编码sde4
作为nrpd1a 。先前所描述的sde4
突变是现在指定nrpd1a - 1 。
1sainsbury实验室,约翰建设起中心,诺里奇
nr4 7uh ,英国。 2university东英格兰,诺里奇
nr4 7tj ,英国。
*向谁函授应予以处理。
电子邮箱: david.baulcombe @是Sainsbury - laboratory.ac.uk
屏幕上有缺陷的突变体,在跨
基因沉默用一种拟南芥线
( gxa ) ,其中绿色荧光蛋白
( GFP )的转基因(图s1a ,指定G )的
鸦雀无声,由马铃薯X病毒( pvx ) -绿色荧光蛋白
转基因(图s1a ,指定一) ( 1 ) 。不像
rdr6突变体,其中完全失去绿色荧光蛋白
沉默在gxa背景下, nrpd1a - 1
展示了一幅延迟性发作的沉默中
生长点的植物(图1A和图。
s1f ) ( 1 ) 。在年轻的植物,叶片初期
涌现出绿色荧光蛋白的荧光,而且,在一个星期内,
沉默出现在局部地区,然后
散布在整个叶片。这种迟发性
表型的坚持,直到开花的时候
年轻的花序均GFP的荧光。
该模式的转基因mRNA和
小分子干扰核糖核酸积累相应的
数额GFP的荧光。因此,北
分析野生型和nrpd1a - 1鲜花
表明,增加积累的GFP
mRNA的表达( 4.5倍)和pvx -绿色荧光蛋白基因的RNA
nrpd1a - 1对应到六倍减少
21日至24日-核苷酸( NT )的绿色荧光蛋白的siRNA (图
1B )条相对野生型。在完全沉默
玫瑰花叶,那里nrpd1a介导的损失
沉默是不太明显高于
花卉,绿色荧光蛋白基因和siRNA金额
媲美。
RNA介导的DNA甲基化( rddm )
是与沉默的植物,并
可能导的一个小分子干扰核糖核酸引导效应
复杂的。一致rddm在绿色荧光蛋白
轨迹gxa植物,绿色荧光蛋白基因的DNA甲基化是
迷失在鲜花的rdr6和sgs3突变体沿
23 。长pfeifhofer等人,威廉斯年限。地中海。 197 , 1525 ( 2003 ) 。
24 。汤匙egawa等人,电流。生物学。 13 , 1252 ( 2003 ) 。
25 。支持由美国国家卫生署( r37 - ai33443 ) 。我们想
谢谢j. pober ,每小时十孙,和D罗斯坦为
认真研读了这份手稿和第十林(大学
水牛) ,为分享card11缺陷
Jurkat细胞。分子相互作用数据已
存放在生物分子相互作用网络
数据库与加入代码209039到209044 。
支持在线材料
www.sciencemag.org/cgi/content/full/308/5718/114/
无线TTL闪光灯
材料与方法
无花果。中一至中三
2004年11月4日接受, 2005年1月14日
10.1126/science.1107107
与绿色荧光蛋白的siRNA ( 1 ) (图1 C ) 。在nrpd1a - 1
花卉,如绿色荧光蛋白的siRNA都减少,但
不缺席,我们只发现有轻微变化
该模式GFP的DNA甲基化(图1 C )
这反差更明显的损失
atsn1 DNA甲基化nrpd1a - 1植物
( 2 , 5 ) 。因此, nrpd1a通路,是不是
唯一来源合适的siRNA为rddm 。
当初nrpd1a - 1 ,在相当大的重排
1号染色体扰乱
at1g63020 (图中一,二至七) ,然后用
其他nrpd1a等位基因与互补
同一个nrpd1a转,以确认
这种基因编码的nrpd1a 。序列
nrpd1a不结盟与拟南芥nrpd1a
同源(编码at2g40030 )和两个
编码蛋白质的水稻植物特有
分支为最大亚基的RNA
聚合酶(图2A及fig.s2 , A至C ) 。
一致nrpd1a作为世界上最大的
亚基一multisubunit油料四,食米
和拟南芥基因组编码两个
蛋白质可以成为第二大
亚基( at3g18090和at3g23780 ) ( 6 )
(图2B和图s2d ) 。测试沉默
的作用,这些基因拟南芥nrpd2
亚基,我们转化野生型gxa
植物倒置重复序列( IR )的构造说
将目标对准了RNAi以nrpd1a ,疑似
nrpd2基因,或阿丹(作为对照组) (图三,
A和B ) 。转化与红外
针对nrpd1a与疑似
nrpd2基因,但并不反对阿丹(图三, c
及d ) ,呈现延迟性发作的沉默
这样的nrpd1a - 1 。虽然两者nrpd2
基因将被灭活,由红外兴建
(图s3b ) ,两条路线的证据表明,
积极nrpd2轨迹,而不是at3g23780
比at3g18090 。第一,基因特异性扭转
转录聚合酶链反应( RT - PCR )
分析结果表明,大部分的nrpd2
誊来自at3g23780 (图s3e )
及第二,在一个插入突变体at3g23780
( nrpd2a - 1 ,图s3f ) ,但不at3g18090
( nrpd2b - 1 ,图s3f )消除了内源
小分子干扰核糖核酸(图3A )在。
nrpd1a和nrpd2有顺序的异同
他们nrpa , nrpb , nrpc
同系物,在地区相应的功能
重要的特点,酵母RNA聚合酶
2005年4月1日第一卷308科学www.sciencemag.org
报告
图。 1 。 GFP的沉默nrpd1a - (一) 1 。紫外线照片gxa野生
型( WT )的,并nrpd1a - 1开花植物。 (二)北方分析绿色荧光蛋白
mRNA的表达和siRNA在花卉(六) ,茎( s )和叶( 1 )由WT和
nrpd1a - 1 gxa植物。 (三) Southern blot分析基因组DNA纯化
二( 7 ) 。为nrpd1a ,地区与认同
nrpb1包括N端钳核心
( 20 % ) ,锌金属结合位点,活跃
网站( 41 % ) ,漏斗和部分裂隙
域(初, 42 % ,末位淘汰,有24 % ) 。该
中的裂隙域nrpa1 ,
nrpb1 , nrpc1缺席nrpd1a
(保守区七) (图s2b ) 。然而,
C端钳核心(图s2b ) ,它定义了
年底球形域之前
C端域( CTD是) nrpb1 ( 7 ) ,是
目前( 23 %相同) 。 nrpd2是34 %相同
以nrpb2并保守区
相对应的结合位点小
核心亚基( nrpb3/ac40 , nrpb10 ,
nrpb12 ) (图s2d ) ,这是思想的发挥
作用于酶大会( 7 ) 。有多重
基因nrpb3/ac40 ,有些企业
他们可以油料四的具体情况。然而,对于
nrpb10和nrpb12现在只有两个基因
每一个在拟南芥中,他们可以分享
油料之间的第四和其他的RNA聚合酶
因为他们是在其他真核生物( 8 ) 。
最引人注目的区别
nrpb1和nrpd1a是在C端的
nrpd1 ,如水稻和拟南芥
蛋白质分享相似的C端
半数一个无编码的蛋白(有缺陷
叶绿体和叶片)规范S rRNA基因
加工叶绿体( 9 ) (图s2a ) 。这
C端延伸,可协调的RNA
聚合酶活性与下游加工
步骤,在方式上类似于向
CTD是ofpolii ( 8 ) 。结合本
不寻常的C端与保守的特点
义RNA聚合酶表明,波兰四是
积极RNA聚合酶与重要分歧
从义RNA聚合酶的一,二和三。
来自同一组织中,作为第(二)项,消化与甲基化敏感性
酶sau96i ,摸索出为GFP的。 unmethylated G和gxa sgs3线
作为对照。 DNA片段大于554新台币,是由于DNA的
甲基化。
图。 2 。进化树
最大型的( a )和
第二大(二)的RNA
聚合酶亚基家庭
从植物中,蠕虫和
酵母。 itoivonthe权
对每棵树显示核糖核酸
聚合酶亚科。灰色
和黑盒子显示
拟南芥油料四亚基。
为了进一步探讨机制的油料
四介导的沉默,我们的另一个特点是
突变与迟发性GFP的沉默
(图s4a ) 。它有一个倒置4号染色体
这会破坏rdr2 (图s4b , rdr2 - 3 ) ,以及
绿色荧光蛋白基因沉默的表型能够加以补充
通过改造与野生型rdr2
基因组DNA (图s4a ) 。在这突变,因为在
nrpd2a - 1和的每一项nrpd1a突变,有
获得较低的数额内源性24 -新台币
siRNA (即atsn1 , 1003 , 02 ,与第2组) ,比
在野生型,而mir167数额
未受影响(图3A )在( 3 ) 。这些的siRNAs都
在24新台币大小级,并dcl3 Dicer的是
参与它们的生源( 3 ) 。这是有可能
因此,油料四, rdr2 , dcl3法
团结起来,为一个沉默的门路。油料四将
产生的RNA的物种被复制到
双链RNA (双链RNA ) rdr2 。
这种双链RNA ,然后被加工成
小分子干扰核糖核酸由dcl3 。
该rdr2和rdp1突变,也
受长期的RNA ,由小分子干扰核糖核酸基因位点。
然而,相反的影响,对小分子干扰核糖核酸,
长期的RNA更为丰富,在沉默
突变体。因此, atsn1 RNA的更多
丰富的,在nrpd1a和rdr2突变体比
在野生型植物(图3 C )条,显示
他们不是油料四誊本。据推测,这
RNA的结果必须由RNA聚合酶三
转录( 10 ) atsn1是沉默
该油料四- rdr2 - dcl3通路在野生型
植物。我们无法侦测,只要油料四
誊atsn1是推测这是因为
他们目前只是非常低的数额和
都是蒙面更丰富的RNA产生
其他的RNA聚合酶。
该油料四- rdr2 - dcl3通路相关
与第2组和2002年的siRNAs并不要求
ago4或DNA甲基化( 3 ) 。然而,
该atsn1和1003点是hypermethylated
在野生型植物相对向nrpd1a万亩
www.sciencemag.org科学卷308 2005年4月1日
报告
图。 3 。分子指标的沉默。 (一)北部的分析里9日,九仓巷10 nrpd1a - 3泳道11 , nrpd1a - 4 lane12 , nrpd2a - 1泳道13
内源性小RNA :车道1日至8日, gxa ( C24为)背景车道9日至nrpd2b - 1 。污点被剥夺和reprobed成倍增长。 (二)南区
13 ,中校- O的背景。 1行,每克巷2 , rdr2 - 3线3条和第4 ,两个分析五常rDNA的重复序列在nrpd1a一系列等位基因消化后,与
独立rdr2 - 3 rdr2p : : rdr2 T2合资格线巷5 , nrpd1a -1 车道6and 7 ,甲基化敏感性酶hpaii 。 (三) RT - PCR分析的内源性
两个独立nrpd1a - 1 nrpd1ap : : nrpd1a T2合资格线巷8 nrpd1a - 2 atsn1誊是高架在rdr2 - 2和nrpd1a突变体。
tants ( 2 ) (图3B )条中,并积累自己
的siRNAs是依赖于argonaute蛋白
ago4 ,从头DNA甲基转移酶
drm1 anddrm2 (五日,十一日,十二日) ,以及油料
四, rdr2 , dcl3 。在这些例子中,它
看来,我们已建议在第pombe
( 13 ) ,即维持沉默涉及
自我强化沉默通路在其中
油料四介导的siRNA生产是依赖
关于ago4介导的DNA甲基化
反之亦然。
theroleofpol四所述herecould
解决的一个悖论染色质沉默
机制是依赖于RNA的。如果
该沉默的基因转录是由一个单一的
聚合酶,这种RNA依赖的机制
不会稳定,因为镇压
转录从这些位点
也将导致亏损沉默的RNA 。
然而,沉默特异性聚合酶像
油料四,可耐染色质或DNA
修改影响聚合酶一至三
等,可以稳定地保持沉默
状态。在动物和真菌的油料四分支
缺席的,但沉默的悖论可能
解决了,如果有形式的核糖核酸
聚合酶一至三与沉默-具体
亚基,使转录的异染色质
,因此,维修
该RNA依赖的沉默。
最后一点,一般约沉默
机制是说明了GFP的跨
基因沉默与内源性24新台币的siRNA
沉默的通路都是依赖
对共和联盟蛋白质(图1018 ) 。在玫瑰叶子
该植物的,这两个沉默途径
是相互独立的,因为跨
基因沉默是不受rdr2 (图1018 )
由于内源性24nt的siRNA坚持
在rdr6植物( 2 ) 。然而,在这些花朵
通路是相互依存的,因为绿色荧光蛋白
沉默是受两rdr2和rdr6 。
这种潜在的沉默通路互动,
结合自己的能力,以形成
反馈和自我加强的循环( 14 ) ,说明
潜在的复杂性内源性
监管网络涉及的siRNAs 。
参考文献及债券
1 。汤匙dalmay ,甲汉密尔顿,第拉德,美国安格尔,直流
baulcombe ,细胞101 , 543 ( 2000 ) 。
2 。
答:哈密尔顿,澳voinnet ,属查,直流baulcombe ,
embo j. 21 , 4671 ( 2002 ) 。
3 。谢种
等人, plos生物学。 2 , e104 ( 2004 ) 出版
在线2004年2月24日。
4 。汤匙沃尔普等人,科学297人, 1833年( 2002年) 出版
在线2002年8月22日( 10.1126/science.1074973 ) 。
5 。素文的影响,陈等人,科学303 , 1336 ( 2004 ) 。
6 。拟南芥基因组的倡议,性质, 408 , 796
( 2000 ) 。
7 。克莱姆页,四答布什内尔,许任kornberg ,
科学
292 , 1863年( 2001年) 网上公布2001年4月19日
( 10.1126/science.1059493 ) 。
8 。克莱姆页,电流。奥平。结构。生物学。 12 , 89 ( 2002 ) 。
9 。米bellaoui ,小gruissem , Planta的219 , 819 ( 2004 ) 。
10 。楼myouga ,第tsuchimoto调野,每小时ohtsubo ,
体育ohtsubo ,基因遗传学。系统。 76 , 169 ( 2001 ) 。
11 。四zilberman等人,电流。生物学。 14 , 1214 ( 2004 ) 。
12 。四zilberman ,十曹时,雅各布森,科学, 299 , 716
( 2003 ) 在网上公布2003年1月9日( 10.1126 /
science.1079695 ) 。
13 。汤匙杉山爱,每小时
凸轮,甲弗德尔,四莫阿塞德,第行列
grewal ,过程。 natl 。 acad 。工商局局长。美国102 , 152 ( 2005 ) 。
14 。四baulcombe ,性质, 431 , 356 ( 2004 ) 。
15 。作者承认资金来自盖茨比
慈善基金会,生物技术和生物
科学研究委员会,以及婴儿,校
威康基金( a.j.h. )以及技术
援助的影响。
支持在线材料
www.sciencemag.org/cgi/content/full/1106910/dc1
材料与方法
无花果。中一至中四
表S1和S2
参考文献及债券
2004年10月29日接受, 2005年1月25日
在网上公布2005年2月3日
10.1126/science.1106910
包括这方面的资料时,引用这个文件。
平移算子的基因
对核糖体:如何抑制物
蛋白质排除核糖体约束力
lasse詹纳, 1帕斯卡romby , 2伯纳德里斯, 1
克莱门斯舒尔策- briese ,三是学生,施普林格, 4 chantal ehresmann , 2
伯纳德ehresmann , 2人Dino moras , 1 gulnara yusupova , 1
赛yusupov1 , 2 *
核糖体的热嗜热是cocrystallized与发起人转让
核糖核酸( tRNA分子)和一个结构完整信使核糖核酸( mRNA的)携带一个平移
运营商。道路mRNA的定义是在5.5埃决议
它比较,无论是与晶体结构相同的核糖体复杂
缺乏表达或联同非结构化mRNA的表达。一个确切核糖体环境
岗位操作者的茎环结构垂直于表面的
核糖体在该平台上的30年代亚基。有约束力的操作者和
首倡者的tRNA发生于核糖体与一个无人居住的tRNA撤离现场,
这是预期为起始复杂。定位监管
域的经营者相对核糖体阐明了分子
机制,即约束抑制物开关过翻译。我们的数据
建议一般以何种方式表达控制元素必须放在了
核糖体,以履行自己的监管任务。
起始翻译一般认定时,应变能力快的需要。有约束力的
效率促进蛋白质的合成,是eubacterial核糖体涉及的几个要素
关键的一步,为控制基因表达的基因,其中影响动力学的研究
2005年4月1日第一卷308科学www.sciencemag.org
希望能和你成为朋友
http://www.vw.com/en.html?sem=googlehttp://www.cars.com/?KNC=LedGogBRDnsNmmNAP&aff=gogsema&jadid=9350919984&jk=cars.&js=1&jmt=1_e_&jp=&jkId=8a8ae4cd34f320c0013511856e432e61&jt=1&jsid=24398&mkwid=sh5trZnDQ_pcrid_9350919984_pmt_e_pkw_cars.&pse=google
http://autos.yahoo.com/
欢迎分享,转载请注明来源:夏雨云
评论列表(0条)