空谷临风
病毒进化
该文章仅适合伯乐(BIO-RAD)仪器的qPCR实验及数据分析
荧光定量(qPCR)程序运行
创建一个新的程序,或者选已经创建好的文件,下一步
选择正确的板子类型,下一步
直接点击Start Run
数据分析
1 使用伯乐的CFX Maestro软件直接查看
选择Gene Expression——Plate Setup——view plate
选中PCR孔,
Target Names是组名填基因的名字或者是管家/内参基因(Actin)
Sample Names填样品的名称
关掉表格,选择是
选择Actin作为内参基因,点击OK
就可以用软件查看基因表达量了。
2 将运行的结果导出,用GraphPad展示
将下边这部分数据导入到GraphPad
选择Mean &SEM
将Expression的数据填入Mean列,将Corrected Expression SEM填入SEM列
点击表格对应的Graphs。
一、原理
在指数阶段,PCR 产物的量在每个循环中大约增加一倍。然而,随着反应的进行,反应组分被消耗,最终一种或多种组分变得有限。此时,反应减慢并进入平台期。
最初,荧光保持在背景水平,即使产物以指数方式累积,也无法检测到荧光的增加。最终,足够的扩增产物积累以产生可检测的荧光信号。
发生这种情况的循环数称为量化循环,或 q。由于 q值是在试剂不受限制的指数阶段测量的,因此可以使用实时 qPCR 根据描述反应进程的已知指数函数可靠和准确地计算反应中存在的模板的初始量。
反应的 Cq主要由扩增反应开始时存在的模板量决定。如果在反应开始时存在大量模板,则需要相对较少的扩增循环来积累足够的产物以产生高于背景的荧光信号。因此,反应将具有低的或早期的 Cq。
二、应用
实时荧光定量 PCR/qPCR 检测已成为快速、灵敏地测定和定量各种生物样品中核酸的首选工具,具有多种应用,例如基因表达分析、食品中转基因生物的检测和癌症表型分析.
在研究实验室中,qPCR 测定广泛用于定量测量转化细胞系中的基因拷贝数(基因剂量)或突变基因的存在。与逆转录 PCR (RT-PCR) 相结合,qPCR 分析可用于精确定量基因表达的变化,例如,通过测量细胞的变化,响应不同环境条件或药物治疗的表达增加或减少mRNA水平。
qPCR/实时 PCR 仪器
实时 PCR 检测系统由配备光学检测模块的热循环仪组成,用于测量每个扩增循环期间荧光团与目标序列结合时产生的荧光信号。
Bio-Rad 实时 PCR 检测系统具有热循环仪和可互换的模块,用于荧光团的单重和多重检测以及固定的实时 PCR 单元。所有 qPCR 系统都具有热梯度功能。
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